Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.78■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms