Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STMND1H3BQB6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STMND1H3BQB6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STMND1H3BQB6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STMND1H3BQB6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STMND1H3BQB6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms