Protein–RNA interactions for Protein: F8VTS6

RFPL4AL1, Ret finger protein-like 4A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4AL1F8VTS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFPL4AL1F8VTS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL4AL1F8VTS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL4AL1F8VTS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL4AL1F8VTS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL4AL1F8VTS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms