Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DIRC3C9JPN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DIRC3C9JPN6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DIRC3C9JPN6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DIRC3C9JPN6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DIRC3C9JPN6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DIRC3C9JPN6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DIRC3C9JPN6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms