Protein–RNA interactions for Protein: C9JG80

NPIPB4, Nuclear pore complex-interacting protein family member B4, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB4C9JG80 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB4C9JG80 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB4C9JG80 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB4C9JG80 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB4C9JG80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB4C9JG80 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPB4C9JG80 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB4C9JG80 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms