Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PATL2C9JE40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PATL2C9JE40 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PATL2C9JE40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PATL2C9JE40 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PATL2C9JE40 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PATL2C9JE40 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PATL2C9JE40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PATL2C9JE40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms