Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH8

HNRNPCL2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL2B2RXH8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HNRNPCL2B2RXH8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HNRNPCL2B2RXH8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPCL2B2RXH8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPCL2B2RXH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPCL2B2RXH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms