Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NNZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A6NNZ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A6NNZ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A6NNZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A6NNZ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NNZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NNZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NNZ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NNZ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NNZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NNZ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NNZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NNZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NNZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NNZ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NNZ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NNZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NNZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NNZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NNZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A6NNZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
A6NNZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A6NNZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NNZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NNZ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NNZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NNZ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NNZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NNZ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
A6NNZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A6NNZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A6NNZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NNZ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NNZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NNZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A6NNZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A6NNZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A6NNZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NNZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NNZ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NNZ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NNZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A6NNZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A6NNZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A6NNZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A6NNZ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A6NNZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A6NNZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A6NNZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A6NNZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A6NNZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A6NNZ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
A6NNZ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
A6NNZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A6NNZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A6NNZ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A6NNZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A6NNZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A6NNZ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A6NNZ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A6NNZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A6NNZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A6NNZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A6NNZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
A6NNZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A6NNZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A6NNZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A6NNZ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A6NNZ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A6NNZ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A6NNZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A6NNZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A6NNZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A6NNZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A6NNZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A6NNZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A6NNZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A6NNZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
A6NNZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A6NNZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A6NNZ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A6NNZ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A6NNZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
A6NNZ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A6NNZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A6NNZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A6NNZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A6NNZ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A6NNZ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A6NNZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A6NNZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A6NNZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
A6NNZ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A6NNZ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A6NNZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A6NNZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A6NNZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A6NNZ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A6NNZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms