Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC01549A6NIU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC01549A6NIU2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC01549A6NIU2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01549A6NIU2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01549A6NIU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01549A6NIU2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01549A6NIU2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms