Protein–RNA interactions for Protein: A6NIJ5

FAM90A20P, Putative protein FAM90A20P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A20PA6NIJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM90A20PA6NIJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A20PA6NIJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM90A20PA6NIJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms