Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABD2BA6NFA1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRABD2BA6NFA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRABD2BA6NFA1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRABD2BA6NFA1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRABD2BA6NFA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms