Protein–RNA interactions for Protein: A6NEE1

PLEKHD1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHD1A6NEE1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PLEKHD1A6NEE1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
PLEKHD1A6NEE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PLEKHD1A6NEE1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PLEKHD1A6NEE1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PLEKHD1A6NEE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PLEKHD1A6NEE1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PLEKHD1A6NEE1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PLEKHD1A6NEE1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
PLEKHD1A6NEE1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PLEKHD1A6NEE1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PLEKHD1A6NEE1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PLEKHD1A6NEE1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PLEKHD1A6NEE1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PLEKHD1A6NEE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PLEKHD1A6NEE1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PLEKHD1A6NEE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PLEKHD1A6NEE1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
PLEKHD1A6NEE1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLEKHD1A6NEE1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PLEKHD1A6NEE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms