Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCCD1A6NED2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCCD1A6NED2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCCD1A6NED2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCCD1A6NED2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCCD1A6NED2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCCD1A6NED2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms