Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM30A4D0T7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM30A4D0T7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM30A4D0T7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM30A4D0T7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms