Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12DA2A288 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZC3H12DA2A288 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZC3H12DA2A288 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12DA2A288 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZC3H12DA2A288 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms