Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0J9YVX5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0J9YVX5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0J9YVX5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0J9YVX5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms