Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J238

TRAV1-2, T-cell receptor alpha variable 1-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV1-2A0A0B4J238 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV1-2A0A0B4J238 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV1-2A0A0B4J238 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV1-2A0A0B4J238 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV1-2A0A0B4J238 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV1-2A0A0B4J238 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV1-2A0A0B4J238 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV1-2A0A0B4J238 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAV1-2A0A0B4J238 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAV1-2A0A0B4J238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV1-2A0A0B4J238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV1-2A0A0B4J238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms