Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 IST3YIR005W 447 nt2.38□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 MSL5YLR116W 1431 nt2.38□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 RPS22BYLR367W 393 nt2.38□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 PTC5YOR090C 1719 nt2.38□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 CSM4YPL200W 471 nt2.38□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 YJL070CYJL070C 2667 nt2.38□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 UBP11YKR098C 2154 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 SSF1YHR066W 1362 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 PEA2YER149C 1263 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 BRP1YGL007W 378 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 YLR458WYLR458W 381 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 TRS20YBR254C 528 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 YCL007CYCL007C 393 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 SAP185YJL098W 3177 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 UBR1YGR184C 5853 nt2.37□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 IST2YBR086C 2841 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 DFG10YIL049W 762 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 CSE4YKL049C 690 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 ICY1YMR195W 384 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 ATX2YOR079C 942 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 MUD1YBR119W 897 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 MGR1YCL044C 1254 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 RRP6YOR001W 2202 nt2.36□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 PUT3YKL015W 2940 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 SPP41YDR464W 4308 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 snR9snR9 187 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 NCB2YDR397C 441 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 SNO3YFL060C 669 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 RAD6YGL058W 519 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 YGR228WYGR228W 345 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 PRP21YJL203W 843 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 ATG38YLR211C 681 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 LSM2YBL026W 288 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 SNO2YNL334C 669 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 MSS18YPR134W 807 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 RAV1YJR033C 4074 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 REV1YOR346W 2958 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 NAN1YPL126W 2691 nt2.35□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 APM3YBR288C 1452 nt2.34□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 AHC2YCR082W 387 nt2.34□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 YGR283CYGR283C 1026 nt2.34□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 RCN1YKL159C 636 nt2.34□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 RBL2YOR265W 321 nt2.34□□□□□ -2.03
SMC6Q12749 RRI2YOL117W 1938 nt2.34□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 RTT107YHR154W 3213 nt2.34□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 RPL40AYIL148W 387 nt2.33□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YJR087WYJR087W 351 nt2.33□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 BRE1YDL074C 2103 nt2.33□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 KOG1YHR186C 4674 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YGR226CYGR226C 210 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 MSL1YIR009W 336 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 ARV1YLR242C 966 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YLR379WYLR379W 375 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 INO80YGL150C 4470 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 NOP14YDL148C 2433 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 SSQ1YLR369W 1974 nt2.32□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 REF2YDR195W 1602 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 RGA1YOR127W 3024 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 UFD4YKL010C 4452 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 CDC53YDL132W 2448 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 BRO1YPL084W 2535 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 NCL1YBL024W 2055 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 TPM2YIL138C 486 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YMR254CYMR254C 309 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 TAE2YPL009C 3117 nt2.31□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 EMP24YGL200C 612 nt2.3□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 VMA21YGR105W 234 nt2.3□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YOR152CYOR152C 771 nt2.3□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 RRP12YPL012W 3687 nt2.3□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 CHZ1YER030W 462 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 LRP1YHR081W 555 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 LCL2YLR104W 396 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YHC1YLR298C 696 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YOR105WYOR105W 327 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YPL080CYPL080C 327 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.29□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 NIC96YFR002W 2520 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 AIM19YIL087C 474 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 PEP8YJL053W 1140 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 LSM7YNL147W 348 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 UBP2YOR124C 3819 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YCL023CYCL023C 348 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 YFR016CYFR016C 3702 nt2.28□□□□□ -2.04
SMC6Q12749 DPB11YJL090C 2295 nt2.28□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 RUD3YOR216C 1455 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 RTT101YJL047C 2529 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 VPH1YOR270C 2523 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 BI4Q0120 1917 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 SCH9YHR205W 2475 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 YDL187CYDL187C 330 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 YDR018CYDR018C 1191 nt2.27□□□□□ -2.05
SMC6Q12749 SCEIQ0160 708 nt2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 269 ms