RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W FAP1P53971 965 aa9.55□□□□□ -0.88
SSQ1YLR369W PRY3P47033 881 aa9.06□□□□□ -0.96
SSQ1YLR369W MTC1P47018 478 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SSQ1YLR369W YCK3P39962 524 aa8.52□□□□□ -1.05
SSQ1YLR369W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SSQ1YLR369W AAD16Q02895 342 aa8.29□□□□□ -1.08
SSQ1YLR369W PRI1P10363 409 aa8.13□□□□□ -1.11
SSQ1YLR369W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SSQ1YLR369W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SSQ1YLR369W YGL015CP33199 130 aa7.44□□□□□ -1.22
SSQ1YLR369W ISW2Q08773 1120 aa7.44□□□□□ -1.22
SSQ1YLR369W RPG1P38249 964 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SSQ1YLR369W MRPL32P25348 183 aa7.3□□□□□ -1.24
SSQ1YLR369W DRS1P32892 752 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SSQ1YLR369W SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SSQ1YLR369W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SSQ1YLR369W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SSQ1YLR369W UBP9P39967 754 aa6.69□□□□□ -1.34
SSQ1YLR369W CDC27P38042 758 aa6.68□□□□□ -1.34
SSQ1YLR369W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SSQ1YLR369W MAP2P38174 421 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SSQ1YLR369W REB1P21538 810 aa6.58□□□□□ -1.36
SSQ1YLR369W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SSQ1YLR369W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SSQ1YLR369W TGL3P40308 642 aa6.4□□□□□ -1.39
SSQ1YLR369W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SSQ1YLR369W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SSQ1YLR369W SLX5P32828 619 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SSQ1YLR369W SCY1P53009 804 aa6.22□□□□□ -1.41
SSQ1YLR369W HOP09932 586 aa6.21□□□□□ -1.42
SSQ1YLR369W DCD1P06773 312 aa6.2□□□□□ -1.42
SSQ1YLR369W AVT3P36062 692 aa6.2□□□□□ -1.42
SSQ1YLR369W SPT21P35209 758 aa6.19□□□□□ -1.42
SSQ1YLR369W TFC8Q12308 588 aa6.19□□□□□ -1.42
SSQ1YLR369W YBL029C-AQ3E756 94 aa6.13□□□□□ -1.43
SSQ1YLR369W YJL171CP46992 396 aa6□□□□□ -1.45
SSQ1YLR369W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SSQ1YLR369W VNX1P42839 908 aa5.97□□□□□ -1.45
SSQ1YLR369W BCH2P36122 765 aa5.96□□□□□ -1.46
SSQ1YLR369W MST1P07236 462 aa5.94□□□□□ -1.46
SSQ1YLR369W FKH1P40466 484 aa5.92□□□□□ -1.46
SSQ1YLR369W SPP1Q03012 353 aa5.91□□□□□ -1.46
SSQ1YLR369W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SSQ1YLR369W RGA2Q06407 1009 aa5.83□□□□□ -1.48
SSQ1YLR369W YOR238WQ08634 303 aa5.83□□□□□ -1.48
SSQ1YLR369W RIM101P33400 625 aa5.8□□□□□ -1.48
SSQ1YLR369W WSC3Q12215 556 aa5.78□□□□□ -1.48
SSQ1YLR369W BMT6Q12291 365 aa5.78□□□□□ -1.48
SSQ1YLR369W EPS1P40557 701 aa5.75□□□□□ -1.49
SSQ1YLR369W BDF1P35817 686 aa5.75□□□□□ -1.49
SSQ1YLR369W TIF11P38912 153 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SSQ1YLR369W LDB19Q12502 818 aa5.67□□□□□ -1.5
SSQ1YLR369W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.64□□□□□ -1.51not detected
SSQ1YLR369W YAP5P40574 245 aa5.6□□□□□ -1.51
SSQ1YLR369W OXP1P28273 1286 aa5.59□□□□□ -1.51
SSQ1YLR369W IOC2Q12072 812 aa5.57□□□□□ -1.52
SSQ1YLR369W ULI1P43604 169 aa5.56□□□□□ -1.52
SSQ1YLR369W PTP3P40048 928 aa5.53□□□□□ -1.52
SSQ1YLR369W GTT3P39996 337 aa5.51□□□□□ -1.53
SSQ1YLR369W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SSQ1YLR369W BBC1P47068 1157 aa5.49□□□□□ -1.53
SSQ1YLR369W BCK2P33306 851 aa5.46□□□□□ -1.54
SSQ1YLR369W RGA1P39083 1007 aa5.46□□□□□ -1.54
SSQ1YLR369W AI2P03876 854 aa5.44□□□□□ -1.54
SSQ1YLR369W RSM7P47150 247 aa5.42□□□□□ -1.54
SSQ1YLR369W RTG1P32607 177 aa5.42□□□□□ -1.54
SSQ1YLR369W PIB1Q06651 286 aa5.39□□□□□ -1.55
SSQ1YLR369W NCR1Q12200 1170 aa5.39□□□□□ -1.55
SSQ1YLR369W TFA1P36100 482 aa5.34□□□□□ -1.55
SSQ1YLR369W MSB4Q12317 492 aa5.33□□□□□ -1.56
SSQ1YLR369W EAP1P36041 632 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SSQ1YLR369W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
SSQ1YLR369W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
SSQ1YLR369W TRP5P00931 707 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSQ1YLR369W SEC61P32915 480 aa5.27□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W SET4P42948 560 aa5.27□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W YOL036WQ08206 761 aa5.27□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W INO80P53115 1489 aa5.27□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W SAP30P38429 201 aa5.22□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W XDJ1P39102 459 aa5.22□□□□□ -1.57
SSQ1YLR369W DPS1P04802 557 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SSQ1YLR369W MRM1P25270 412 aa5.21□□□□□ -1.58
SSQ1YLR369W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SSQ1YLR369W PRE3P38624 215 aa5.19□□□□□ -1.58
SSQ1YLR369W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SSQ1YLR369W YLR271WQ06152 274 aa5.18□□□□□ -1.58
SSQ1YLR369W VRP1P37370 817 aa5.15□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W SRC1Q03707 834 aa5.15□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W DBP1P24784 617 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W YFR006WP43590 535 aa5.13□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data5.13□□□□□ -1.59not detected
SSQ1YLR369W DAN4P47179 1161 aa5.13□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W YDL129WQ07555 291 aa5.12□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W SAM3Q08986 587 aa5.12□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W VPS29P38759 282 aa5.1□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W JIP4Q03361 876 aa5.09□□□□□ -1.59
SSQ1YLR369W STS1P38637 319 aa5.07□□□□□ -1.6
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