Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms