Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 ATG38YLR211C 681 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 PDP3YLR455W 915 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 GIM3YNL153C 390 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 MIX23YBL107C 591 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 NCS2YNL119W 1482 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 SPF1YEL031W 3648 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 PES4YFR023W 1836 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YDR018CYDR018C 1191 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YIL082WYIL082W 873 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YJR087WYJR087W 351 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 ATP7YKL016C 525 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 SRP21YKL122C 504 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 KTI11YBL071W-A 249 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 IGO1YNL157W 507 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YOL029CYOL029C 606 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 SFM1YOR021C 642 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 DGK1YOR311C 873 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 RSA1YPL193W 1146 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 CSM4YPL200W 471 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.05□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 snR9snR9 187 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 DAD1YDR016C 285 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 NCB2YDR397C 441 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 TMA20YER007C-A 546 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 FAR7YFR008W 666 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 SDL1YIL167W 633 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 VPS51YKR020W 495 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 PSO2YMR137C 1986 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 TRM7YBR061C 933 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 KAR9YPL269W 1935 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 JID1YPR061C 906 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YPR153WYPR153W 423 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YBR277CYBR277C 402 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 UBR1YGR184C 5853 nt2.04□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YRR1YOR162C 2433 nt2.03□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 MSL5YLR116W 1431 nt2.03□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.03□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.03□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 BET3YKR068C 582 nt2.03□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 BNI1YNL271C 5862 nt2.03□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 CLN3YAL040C 1743 nt2.03□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 UBP15YMR304W 3693 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YKL075CYKL075C 1353 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YHR054CYHR054C 1065 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YLR224WYLR224W 1110 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YLR271WYLR271W 825 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 SAS2YMR127C 1017 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YMR144WYMR144W 1029 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YNL150WYNL150W 408 nt2.02□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 snR59snR59 78 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 GCN4YEL009C 846 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YJL086CYJL086C 369 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 ACF4YJR083C 930 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 GMC2YLR445W 567 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 ATP18YML081C-A 180 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 VTI1YMR197C 654 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YOR169CYOR169C 465 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 ARR2YPR200C 393 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 TOF1YNL273W 3717 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 SAP190YKR028W 3102 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 GIP3YPL137C 3831 nt2.01□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 PRK1YIL095W 2433 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 SNF12YNR023W 1701 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YJL070CYJL070C 2667 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YMR045CYMR045C 5268 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YDR029WYDR029W 315 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 VMA21YGR105W 234 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 BUD19YJL188C 309 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 USO1YDL058W 5373 nt2□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 TFC3YAL001C 3483 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 GAL80YML051W 1308 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 SHE4YOR035C 2370 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 OCA6YDR067C 675 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YGR228WYGR228W 345 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YGR242WYGR242W 309 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 AIM32YML050W 936 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YOL150CYOL150C 312 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 RBL2YOR265W 321 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 NSL1YPL233W 651 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YCL023CYCL023C 348 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 RRP6YOR001W 2202 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 IST2YBR086C 2841 nt1.99□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 GDI1YER136W 1356 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 LEU3YLR451W 2661 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 UTP22YGR090W 3714 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 VPS74YDR372C 1038 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YDR537CYDR537C 606 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 SLX9YGR081C 633 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 CCW14YLR390W-A 717 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 ALG14YBR070C 714 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 VPS13YLL040C 9435 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 SSE1YPL106C 2082 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 ECM25YJL201W 1800 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 SSF1YHR066W 1362 nt1.98□□□□□ -2.09
PRP46Q12417 YOL098CYOL098C 3114 nt1.97□□□□□ -2.09
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