Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.78■□□□□ 0.6
PRP46Q12417 NSR1YGR159C 1245 nt18.65■□□□□ 0.58
PRP46Q12417 NOP1YDL014W 984 nt18.34■□□□□ 0.53
PRP46Q12417 YKL036CYKL036C 393 nt17.01■□□□□ 0.31
PRP46Q12417 MDJ1YFL016C 1536 nt16.43■□□□□ 0.22
PRP46Q12417 Q0297Q0297 156 nt16.13■□□□□ 0.17
PRP46Q12417 SRX1YKL086W 384 nt16.05■□□□□ 0.16
PRP46Q12417 YJL027CYJL027C 417 nt15.86■□□□□ 0.13
PRP46Q12417 SCS3YGL126W 1143 nt15.53■□□□□ 0.08
PRP46Q12417 YCR051WYCR051W 669 nt15.16■□□□□ 0.02
PRP46Q12417 YOL085CYOL085C 342 nt14.74□□□□□ -0.05
PRP46Q12417 DBP2YNL112W 1641 nt14.62□□□□□ -0.07
PRP46Q12417 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.47□□□□□ -0.09
PRP46Q12417 RPP1BYDL130W 321 nt14.44□□□□□ -0.1
PRP46Q12417 PKP1YIL042C 1185 nt14.44□□□□□ -0.1
PRP46Q12417 CCC1YLR220W 969 nt14.21□□□□□ -0.13
PRP46Q12417 YBR190WYBR190W 312 nt14.03□□□□□ -0.16
PRP46Q12417 SCJ1YMR214W 1134 nt13.94□□□□□ -0.18
PRP46Q12417 ATS1YAL020C 1002 nt13.91□□□□□ -0.18
PRP46Q12417 PET122YER153C 765 nt13.77□□□□□ -0.21
PRP46Q12417 RVS167YDR388W 1449 nt13.73□□□□□ -0.21
PRP46Q12417 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.69□□□□□ -0.22
PRP46Q12417 RTC3YHR087W 336 nt13.63□□□□□ -0.23
PRP46Q12417 SCR1SCR1 522 nt13.63□□□□□ -0.23
PRP46Q12417 RRN5YLR141W 1092 nt13.37□□□□□ -0.27
PRP46Q12417 SHR5YOL110W 714 nt13.31□□□□□ -0.28
PRP46Q12417 YDJ1YNL064C 1230 nt13.29□□□□□ -0.28
PRP46Q12417 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.13□□□□□ -0.31
PRP46Q12417 RSB1YOR049C 1065 nt13.1□□□□□ -0.31
PRP46Q12417 PST2YDR032C 597 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP46Q12417 GAR1YHR089C 618 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP46Q12417 URN1YPR152C 1398 nt12.84□□□□□ -0.35
PRP46Q12417 DEP1YAL013W 1218 nt12.81□□□□□ -0.36
PRP46Q12417 RPN10YHR200W 807 nt12.69□□□□□ -0.38
PRP46Q12417 YNL208WYNL208W 600 nt12.69□□□□□ -0.38
PRP46Q12417 OPI9YLR338W 858 nt12.68□□□□□ -0.38
PRP46Q12417 PUT4YOR348C 1884 nt12.66□□□□□ -0.38
PRP46Q12417 SAH1YER043C 1350 nt12.53□□□□□ -0.4
PRP46Q12417 TIR1YER011W 765 nt12.48□□□□□ -0.41
PRP46Q12417 ARE1YCR048W 1833 nt12.45□□□□□ -0.42
PRP46Q12417 YKL097CYKL097C 411 nt12.4□□□□□ -0.42
PRP46Q12417 SHU1YHL006C 453 nt12.32□□□□□ -0.44
PRP46Q12417 SSA1YAL005C 1929 nt12.32□□□□□ -0.44
PRP46Q12417 PUN1YLR414C 792 nt12.31□□□□□ -0.44
PRP46Q12417 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.28□□□□□ -0.44
PRP46Q12417 YJR018WYJR018W 363 nt12.27□□□□□ -0.45
PRP46Q12417 POA1YBR022W 534 nt12.23□□□□□ -0.45
PRP46Q12417 YJR120WYJR120W 351 nt12.17□□□□□ -0.46
PRP46Q12417 SSA3YBL075C 1950 nt12.16□□□□□ -0.46
PRP46Q12417 SRB2YHR041C 633 nt12.15□□□□□ -0.46
PRP46Q12417 PTC2YER089C 1395 nt12.09□□□□□ -0.47
PRP46Q12417 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.04□□□□□ -0.48
PRP46Q12417 RPP2BYDR382W 333 nt12.03□□□□□ -0.48
PRP46Q12417 BSC6YOL137W 1494 nt11.97□□□□□ -0.49
PRP46Q12417 BUD23YCR047C 828 nt11.95□□□□□ -0.5
PRP46Q12417 NAB2YGL122C 1578 nt11.95□□□□□ -0.5
PRP46Q12417 WWM1YFL010C 636 nt11.93□□□□□ -0.5
PRP46Q12417 YGR021WYGR021W 873 nt11.93□□□□□ -0.5
PRP46Q12417 HOM6YJR139C 1080 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP46Q12417 YOR139CYOR139C 393 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP46Q12417 INM2YDR287W 879 nt11.84□□□□□ -0.51
PRP46Q12417 BDH2YAL061W 1254 nt11.84□□□□□ -0.51
PRP46Q12417 FIS1YIL065C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
PRP46Q12417 MNP1YGL068W 585 nt11.82□□□□□ -0.52
PRP46Q12417 DAL1YIR027C 1383 nt11.81□□□□□ -0.52
PRP46Q12417 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.79□□□□□ -0.52
PRP46Q12417 NPL3YDR432W 1245 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP46Q12417 RKM5YLR137W 1104 nt11.72□□□□□ -0.53
PRP46Q12417 LSM3YLR438C-A 270 nt11.72□□□□□ -0.53
PRP46Q12417 YOL037CYOL037C 354 nt11.72□□□□□ -0.53
PRP46Q12417 YBL100CYBL100C 315 nt11.71□□□□□ -0.53
PRP46Q12417 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
PRP46Q12417 FPR4YLR449W 1179 nt11.7□□□□□ -0.54
PRP46Q12417 FUN26YAL022C 1554 nt11.58□□□□□ -0.55
PRP46Q12417 TRM9YML014W 840 nt11.56□□□□□ -0.56
PRP46Q12417 CCT6YDR188W 1641 nt11.49□□□□□ -0.57
PRP46Q12417 YPS1YLR120C 1710 nt11.45□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 YDR095CYDR095C 411 nt11.43□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.43□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.43□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.43□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.43□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.43□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 YLR281CYLR281C 468 nt11.42□□□□□ -0.58
PRP46Q12417 SPT5YML010W 3192 nt11.39□□□□□ -0.59
PRP46Q12417 ALF1YNL148C 765 nt11.37□□□□□ -0.59
PRP46Q12417 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.36□□□□□ -0.59
PRP46Q12417 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.36□□□□□ -0.59
PRP46Q12417 WHI5YOR083W 888 nt11.34□□□□□ -0.59
PRP46Q12417 PUS2YGL063W 1113 nt11.29□□□□□ -0.6
PRP46Q12417 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.27□□□□□ -0.61
PRP46Q12417 SIS1YNL007C 1059 nt11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms