Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 CCDC47-206ENST00000584112 588 ntTSL 210.99□□□□□ -0.653e-9■□□□□ 10.9
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TRA2AQ13595 STT3A-215ENST00000531599 973 ntTSL 38.03□□□□□ -1.123e-9■□□□□ 10.9
TRA2AQ13595 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.243e-9■□□□□ 10.9
TRA2AQ13595 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.323e-9■□□□□ 10.9
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TRA2AQ13595 STT3A-208ENST00000526726 582 ntTSL 34.08□□□□□ -1.763e-9■□□□□ 10.9
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TRA2AQ13595 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.293e-18■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.623e-18■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 SLC38A2-210ENST00000551405 526 ntTSL 416.49■□□□□ 0.236e-10■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 SLC38A2-213ENST00000553252 846 ntTSL 216.42■□□□□ 0.226e-10■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 SLC38A2-203ENST00000547252 847 ntTSL 38.34□□□□□ -1.076e-10■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.126e-10■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.91□□□□□ -1.786e-10■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 DDX39A-206ENST00000587730 1813 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)20.25■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.683e-7■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-7■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 POTEE-203ENST00000514256 2072 ntTSL 214.33□□□□□ -0.123e-7■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 POTEE-202ENST00000358087 2147 ntTSL 212.71□□□□□ -0.383e-7■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.63e-7■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 POTEE-205ENST00000626191 2027 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.813e-7■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 58.03□□□□□ -1.121e-12■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 26.27□□□□□ -1.411e-12■□□□□ 10.8
TRA2AQ13595 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.458e-10■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.548e-10■□□□□ 10.7
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