RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568151.1

SPG7-217, Transcript of SPG7, paraplegin matrix AAA peptidase subunit, humanhuman

TSL 4

Gene SPG7, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7-217ENST00000568151 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.96■■■■■ 6.55
SPG7-217ENST00000568151 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.87■■■■■ 5.57
SPG7-217ENST00000568151 ABCC9O60706 1549 aa49.1■■■■■ 5.45
SPG7-217ENST00000568151 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.07■■■■■ 5.12
SPG7-217ENST00000568151 NACADO15069 1562 aa46.94■■■■■ 5.11
SPG7-217ENST00000568151 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.83■■■■■ 5.09
SPG7-217ENST00000568151 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.57■■■■■ 5.05
SPG7-217ENST00000568151 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
SPG7-217ENST00000568151 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.27■■■■■ 5
SPG7-217ENST00000568151 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.08■■■■■ 4.97
SPG7-217ENST00000568151 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
SPG7-217ENST00000568151 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.72■■■■■ 4.91
SPG7-217ENST00000568151 SCRIBQ14160 1630 aa45.49■■■■■ 4.87
SPG7-217ENST00000568151 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.4■■■■■ 4.86
SPG7-217ENST00000568151 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.13■■■■■ 4.82
SPG7-217ENST00000568151 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
SPG7-217ENST00000568151 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.41■■■■■ 4.7
SPG7-217ENST00000568151 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.14■■■■■ 4.66
SPG7-217ENST00000568151 SMARCA4P51532 1647 aa43.48■■■■■ 4.55
SPG7-217ENST00000568151 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
SPG7-217ENST00000568151 NCAPD3P42695 1498 aa43.34■■■■■ 4.53
SPG7-217ENST00000568151 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.32■■■■■ 4.53
SPG7-217ENST00000568151 SMARCA2P51531 1590 aa43.23■■■■■ 4.51
SPG7-217ENST00000568151 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.14■■■■■ 4.5
SPG7-217ENST00000568151 HMGXB3Q12766 1538 aa43.09■■■■■ 4.49
SPG7-217ENST00000568151 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.07■■■■■ 4.48
SPG7-217ENST00000568151 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
SPG7-217ENST00000568151 WIZO95785 1651 aa42.66■■■■■ 4.42
SPG7-217ENST00000568151 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
SPG7-217ENST00000568151 NESP48681 1621 aa42.42■■■■■ 4.38
SPG7-217ENST00000568151 ERCC6Q03468 1493 aa42.3■■■■■ 4.36
SPG7-217ENST00000568151 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.23■■■■■ 4.35
SPG7-217ENST00000568151 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
SPG7-217ENST00000568151 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.05■■■■■ 4.32
SPG7-217ENST00000568151 CUX2O14529 1486 aa41.98■■■■■ 4.31
SPG7-217ENST00000568151 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.94■■■■■ 4.3
SPG7-217ENST00000568151 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.91■■■■■ 4.3
SPG7-217ENST00000568151 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
SPG7-217ENST00000568151 CFTRP13569 1480 aa41.75■■■■■ 4.27
SPG7-217ENST00000568151 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.68■■■■■ 4.26
SPG7-217ENST00000568151 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.57■■■■■ 4.25
SPG7-217ENST00000568151 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.55■■■■■ 4.24
SPG7-217ENST00000568151 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.53■■■■■ 4.24
SPG7-217ENST00000568151 WDR62O43379 1518 aa41.44■■■■■ 4.23
SPG7-217ENST00000568151 PRDM2Q13029 1718 aa41.41■■■■■ 4.22
SPG7-217ENST00000568151 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
SPG7-217ENST00000568151 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
SPG7-217ENST00000568151 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.07■■■■■ 4.17
SPG7-217ENST00000568151 TOPBP1Q92547 1522 aa40.88■■■■■ 4.14
SPG7-217ENST00000568151 ABCC8Q09428 1581 aa40.82■■■■■ 4.12
SPG7-217ENST00000568151 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.81■■■■■ 4.12
SPG7-217ENST00000568151 IFT140Q96RY7 1462 aa40.68■■■■■ 4.1
SPG7-217ENST00000568151 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
SPG7-217ENST00000568151 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
SPG7-217ENST00000568151 CUX1P39880 1505 aa40.49■■■■■ 4.07
SPG7-217ENST00000568151 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
SPG7-217ENST00000568151 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
SPG7-217ENST00000568151 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.38■■■■■ 4.05
SPG7-217ENST00000568151 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.37■■■■■ 4.05
SPG7-217ENST00000568151 SOGA1O94964 1423 aa40.33■■■■■ 4.05
SPG7-217ENST00000568151 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.29■■■■■ 4.044e-12■□□□□ 8.5
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SPG7-217ENST00000568151 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
SPG7-217ENST00000568151 WDR97A6NE52 1622 aa40.09■■■■■ 4.01
SPG7-217ENST00000568151 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.01
SPG7-217ENST00000568151 SYNJ1O43426 1573 aa40.04■■■■■ 4
SPG7-217ENST00000568151 TOP2BQ02880 1626 aa40.04■■■■■ 4
SPG7-217ENST00000568151 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.04■■■■■ 4
SPG7-217ENST00000568151 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.96■■■■□ 3.99
SPG7-217ENST00000568151 CHD1O14646 1710 aa39.94■■■■□ 3.98
SPG7-217ENST00000568151 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.9■■■■□ 3.98
SPG7-217ENST00000568151 GRIN2BQ13224 1484 aa39.89■■■■□ 3.98
SPG7-217ENST00000568151 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.86■■■■□ 3.97
SPG7-217ENST00000568151 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.85■■■■□ 3.97
SPG7-217ENST00000568151 FBLN2P98095 1184 aa39.82■■■■□ 3.97
SPG7-217ENST00000568151 PBRM1Q86U86 1689 aa39.82■■■■□ 3.96
SPG7-217ENST00000568151 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
SPG7-217ENST00000568151 SYNJ2O15056 1496 aa39.67■■■■□ 3.94
SPG7-217ENST00000568151 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
SPG7-217ENST00000568151 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
SPG7-217ENST00000568151 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
SPG7-217ENST00000568151 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
SPG7-217ENST00000568151 TRIM41Q8WV44 630 aa39.57■■■■□ 3.93
SPG7-217ENST00000568151 ARHGEF11O15085 1522 aa39.56■■■■□ 3.92
SPG7-217ENST00000568151 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.5■■■■□ 3.91
SPG7-217ENST00000568151 ADAMTS12P58397 1594 aa39.49■■■■□ 3.91
SPG7-217ENST00000568151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.47■■■■□ 3.91
SPG7-217ENST00000568151 GRIN2AQ12879 1464 aa39.39■■■■□ 3.9
SPG7-217ENST00000568151 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.39■■■■□ 3.9
SPG7-217ENST00000568151 KIF27Q86VH2 1401 aa39.25■■■■□ 3.87
SPG7-217ENST00000568151 NUP160Q12769 1436 aa39.24■■■■□ 3.87
SPG7-217ENST00000568151 ARAP1Q96P48 1450 aa39.24■■■■□ 3.87
SPG7-217ENST00000568151 CEP170Q5SW79 1584 aa39.23■■■■□ 3.87
SPG7-217ENST00000568151 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.19■■■■□ 3.86
SPG7-217ENST00000568151 IGF1RP08069 1367 aa39.16■■■■□ 3.86
SPG7-217ENST00000568151 CUL7Q14999 1698 aa39.05■■■■□ 3.84
SPG7-217ENST00000568151 SHROOM2Q13796 1616 aa38.99■■■■□ 3.83
SPG7-217ENST00000568151 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.96■■■■□ 3.83
SPG7-217ENST00000568151 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.91■■■■□ 3.82
SPG7-217ENST00000568151 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.9■■■■□ 3.82
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