Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFLP07196 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFLP07196 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFLP07196 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFLP07196 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFLP07196 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFLP07196 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFLP07196 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFLP07196 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFLP07196 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFLP07196 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFLP07196 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFLP07196 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFLP07196 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFLP07196 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms