Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms