Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CARD17Q5XLA6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CARD17Q5XLA6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms