Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SS18Q15532 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SS18Q15532 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SS18Q15532 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SS18Q15532 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms