RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.83■■■□□ 2.53
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RPS6KA3-201ENST00000379565 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 APLP2Q06481 763 aa27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA3-201ENST00000379565 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
RPS6KA3-201ENST00000379565 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
RPS6KA3-201ENST00000379565 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.95■■□□□ 1.9
RPS6KA3-201ENST00000379565 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.78■■□□□ 1.88
RPS6KA3-201ENST00000379565 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.43■■□□□ 1.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM41Q8WV44 630 aa26.33■■□□□ 1.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
RPS6KA3-201ENST00000379565 NEFLP07196 543 aa26.13■■□□□ 1.77
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.12■■□□□ 1.77
RPS6KA3-201ENST00000379565 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
RPS6KA3-201ENST00000379565 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
RPS6KA3-201ENST00000379565 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA3-201ENST00000379565 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA3-201ENST00000379565 ITGAEP38570 1179 aa25.83■■□□□ 1.73
RPS6KA3-201ENST00000379565 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RPS6KA3-201ENST00000379565 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
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RPS6KA3-201ENST00000379565 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC24A1O60721 1099 aa25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM52Q96A61 297 aa25■■□□□ 1.59
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA3-201ENST00000379565 BCANQ96GW7 911 aa24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA3-201ENST00000379565 FBLN2P98095 1184 aa24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA3-201ENST00000379565 BCL11AQ9H165 835 aa24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA3-201ENST00000379565 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA3-201ENST00000379565 NEUROD1Q13562 356 aa24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA3-201ENST00000379565 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA3-201ENST00000379565 HRCP23327 699 aa24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA3-201ENST00000379565 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA3-201ENST00000379565 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.69■■□□□ 1.54
RPS6KA3-201ENST00000379565 ARID3CA6NKF2 412 aa24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA3-201ENST00000379565 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 NEFMP07197 916 aa24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
RPS6KA3-201ENST00000379565 ABCC9O60706 1549 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA3-201ENST00000379565 P3H3Q8IVL6 736 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANP32CO43423 234 aa24.33■■□□□ 1.48
RPS6KA3-201ENST00000379565 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA3-201ENST00000379565 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA3-201ENST00000379565 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA3-201ENST00000379565 A0A0G2JS52 829 aa24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA3-201ENST00000379565 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA3-201ENST00000379565 PLEKHG5O94827 1062 aa23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA3-201ENST00000379565 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA3-201ENST00000379565 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA3-201ENST00000379565 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA3-201ENST00000379565 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.414e-8■□□□□ 9.7
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RPS6KA3-201ENST00000379565 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
RPS6KA3-201ENST00000379565 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.79■■□□□ 1.4
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
RPS6KA3-201ENST00000379565 C14orf37Q86TY3 774 aa23.74■■□□□ 1.39
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RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA3-201ENST00000379565 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA3-201ENST00000379565 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA3-201ENST00000379565 TONSLQ96HA7 1378 aa23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA3-201ENST00000379565 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA3-201ENST00000379565 ARXQ96QS3 562 aa23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3-201ENST00000379565 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA3-201ENST00000379565 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA3-201ENST00000379565 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.353e-6■□□□□ 11.2
RPS6KA3-201ENST00000379565 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMC1Q8TDI8 760 aa23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3-201ENST00000379565 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3-201ENST00000379565 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSPY4P0CV99 314 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSPY10P0CW01 314 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3-201ENST00000379565 FKBP8Q14318 412 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RPS6KA3-201ENST00000379565 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3-201ENST00000379565 KCNH8Q96L42 1107 aa23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3-201ENST00000379565 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
RPS6KA3-201ENST00000379565 NPHP1O15259 732 aa23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA3-201ENST00000379565 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.3■■□□□ 1.32
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