Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COMMD3-BMI1R4GMX3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COMMD3-BMI1R4GMX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD3-BMI1R4GMX3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD3-BMI1R4GMX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD3-BMI1R4GMX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD3-BMI1R4GMX3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD3-BMI1R4GMX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3-BMI1R4GMX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD3-BMI1R4GMX3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms