Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAB39Q9Y376 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAB39Q9Y376 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAB39Q9Y376 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAB39Q9Y376 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms