Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GINS2Q9Y248 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GINS2Q9Y248 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINS2Q9Y248 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GINS2Q9Y248 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GINS2Q9Y248 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GINS2Q9Y248 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GINS2Q9Y248 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms