Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IGSF9BQ9UPX0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF9BQ9UPX0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF9BQ9UPX0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF9BQ9UPX0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms