Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms