Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ALKQ9UM73 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ALKQ9UM73 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ALKQ9UM73 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ALKQ9UM73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ALKQ9UM73 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ALKQ9UM73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ALKQ9UM73 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ALKQ9UM73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ALKQ9UM73 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ALKQ9UM73 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
ALKQ9UM73 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ALKQ9UM73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ALKQ9UM73 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ALKQ9UM73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ALKQ9UM73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ALKQ9UM73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms