Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.61■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC51.57■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC51.57■■■■■ 5.85
SHROOM4Q9ULL8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC51.56■■■■■ 5.84
SHROOM4Q9ULL8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
SHROOM4Q9ULL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
SHROOM4Q9ULL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC51.53■■■■■ 5.84
SHROOM4Q9ULL8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC51.52■■■■■ 5.84
SHROOM4Q9ULL8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
SHROOM4Q9ULL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
SHROOM4Q9ULL8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.46■■■■■ 5.83
SHROOM4Q9ULL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
SHROOM4Q9ULL8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
SHROOM4Q9ULL8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
SHROOM4Q9ULL8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
SHROOM4Q9ULL8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
SHROOM4Q9ULL8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
SHROOM4Q9ULL8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
SHROOM4Q9ULL8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.37■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC51.32■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC51.32■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC51.32■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC51.32■■■■■ 5.81
SHROOM4Q9ULL8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC51.31■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC51.3■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC51.3■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC51.29■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.26■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
SHROOM4Q9ULL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.24■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.23■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC51.22■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
SHROOM4Q9ULL8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC51.17■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC51.13■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC51.13■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
SHROOM4Q9ULL8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
SHROOM4Q9ULL8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
SHROOM4Q9ULL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
SHROOM4Q9ULL8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC50.97■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC50.97■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC50.97■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC50.95■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
SHROOM4Q9ULL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
SHROOM4Q9ULL8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC50.92■■■■■ 5.74
SHROOM4Q9ULL8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
SHROOM4Q9ULL8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
SHROOM4Q9ULL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
SHROOM4Q9ULL8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC50.88■■■■■ 5.74
SHROOM4Q9ULL8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC50.88■■■■■ 5.74
SHROOM4Q9ULL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms