Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
MED23Q9ULK4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MED23Q9ULK4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MED23Q9ULK4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MED23Q9ULK4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
MED23Q9ULK4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MED23Q9ULK4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MED23Q9ULK4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MED23Q9ULK4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MED23Q9ULK4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MED23Q9ULK4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MED23Q9ULK4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MED23Q9ULK4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MED23Q9ULK4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms