Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DENND2AQ9ULE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DENND2AQ9ULE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DENND2AQ9ULE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DENND2AQ9ULE3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DENND2AQ9ULE3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DENND2AQ9ULE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DENND2AQ9ULE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DENND2AQ9ULE3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
DENND2AQ9ULE3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DENND2AQ9ULE3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DENND2AQ9ULE3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DENND2AQ9ULE3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DENND2AQ9ULE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DENND2AQ9ULE3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
DENND2AQ9ULE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
DENND2AQ9ULE3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DENND2AQ9ULE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DENND2AQ9ULE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DENND2AQ9ULE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms