Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCOLCE2Q9UKZ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCOLCE2Q9UKZ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCOLCE2Q9UKZ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCOLCE2Q9UKZ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCOLCE2Q9UKZ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCOLCE2Q9UKZ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms