Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT11Q9UKZ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT11Q9UKZ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT11Q9UKZ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNOT11Q9UKZ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT11Q9UKZ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms