Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP50Q9UKX7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP50Q9UKX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP50Q9UKX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP50Q9UKX7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP50Q9UKX7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms