Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms