Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD1Q9UIS9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD1Q9UIS9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MBD1Q9UIS9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MBD1Q9UIS9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD1Q9UIS9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms