Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMTOR3Q9UHA4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMTOR3Q9UHA4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMTOR3Q9UHA4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms