Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3BQ9UH17 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBEC3BQ9UH17 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3BQ9UH17 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3BQ9UH17 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3BQ9UH17 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3BQ9UH17 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms