Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLKQ9UBE8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLKQ9UBE8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLKQ9UBE8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLKQ9UBE8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLKQ9UBE8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms