Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD2Q9UBB5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD2Q9UBB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD2Q9UBB5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD2Q9UBB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD2Q9UBB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms