Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREM2Q9NZC2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TREM2Q9NZC2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREM2Q9NZC2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TREM2Q9NZC2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREM2Q9NZC2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms