Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
MIS18AQ9NYP9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MIS18AQ9NYP9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MIS18AQ9NYP9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MIS18AQ9NYP9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MIS18AQ9NYP9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MIS18AQ9NYP9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MIS18AQ9NYP9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MIS18AQ9NYP9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MIS18AQ9NYP9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
MIS18AQ9NYP9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MIS18AQ9NYP9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MIS18AQ9NYP9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MIS18AQ9NYP9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MIS18AQ9NYP9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms