Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDE1Q9NXR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDE1Q9NXR1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDE1Q9NXR1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDE1Q9NXR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDE1Q9NXR1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms